Хромато масс-спектрометрия микробных маркеров
Описание анализа и подготовку к нему Вы можете посмотреть, кликнув на название анализа.
Хромато масс-спектрометрия микробных маркеров по Осипову
Срок исполнения: 10-24
Материал исследования:
Кровь из вены
слюна;
сперма;
моча
канал
соскоб из уретры;
соскоб из цервикального канала и влагалища
Смотреть адреса клиники
Описание
Показания
Подготовка
Интерпретация
Описание исследования
Организм каждого человека представляет собой «плацдарм» для всякого рода микроорганизмов – бактерий, грибов, вирусов, которые образуют колонии на внутренних органах, слизистых оболочках и кожных покровах. Их совокупность получила название микробиом или микробиологический статус человека. Изучение его состояния является новым направлением в микробиологии. Исследования микробиома позволяют проводить диагностику инфекций, дисбиозов, воспалений. В их основе лежит изучение маркеров – специфических химических веществ, выделяемых микроорганизмами. Оно применимо для любых их групп.
От состояния микроэкологического статуса зависит функциональность органов и систем организма человека. Нормальная микрофлора имеет определенный состав и характерные особенности для каждого биотопа (локальной области обитания, однородной по абиотическим факторам среды). Она выступает в роли первичного защитного барьера организма, покрывая слизистые оболочки, кожу и кишечные стенки. Количество клеток микроорганизмов составляет порядка 10^9. В зависимости от воздействия на организм различных факторов, микрофлора претерпевает изменения, могущие повлечь за собой весьма неприятные последствия. Поэтому исследование состояния микробиома и восстановление нарушений в нем крайне важно́.
Основная часть микрофлоры человека обитает в кишечнике. Те факты, которые известны о совокупности населяющих его микроорганизмов (микробиоценозе), дают достаточно информации для понимания механизмов его функционирования. Однако этого недостаточно при таких нарушениях, как дисбиоз, требующих для диагностики и принятия решения о назначении терапии выяснения количественных и качественных изменений состава микрофлоры. Проявление дисбаланса могут иметь разные формы: расстройства кишечника, заболевания кожных покровов, нарушения функций половой системы, сердечных патологий и т.д.
Как уже отмечалось выше, новый метод диагностики основывается на изучении микробных маркеров – химических веществ, которые содержатся в стенках клеток микроорганизмов или являются продуктами их жизнедеятельности. Как правило, это разнообразные жирные кислоты, которые не содержатся в организме человека. Наличие достаточно чувствительного метода исследования – газовой хромотографии в сочетании с масс-спектрометрией (ГМ-МС), позволяет точно определить по масс-спектру химическую природу вещества. Для этого достаточно содержания его малых количеств в биологических жидкостях человеческого организма. При проведении анализа из них извлекаются высшие жирные кислоты, после чего они разделяются на хроматографе и анализируются на масс-спектометре. По полученным данным делается вывод о составе микрофлоры.
Преимущество данного метода исследования в возможности одновременного определения количественного состава большого ряда микроорганизмов. При этом не требуется предварительная их культивация и прочие дополнительные манипуляции – анализ проводится в режиме реального времени. Изменение количественных показателей позволяет наблюдать динамику изменения микрофлоры во время проведения терапии антибиотиками или пробиотиками.
Чувствительность данного метода исследования составляет 10^4 - 10^5 клеток в исследуемом образце, селективность анализа – до вида, если маркер имеется в наличии.
Подготовка к исследованию
Кровь
Анализ крови отбирается из вены. Материал желательно сдавать натощак.
Общие рекомендации:
- накануне исследования избегать физических и эмоциональных перегрузок;
- за сутки до обследования запрещен прием алкоголя, за час – курение;
- перед тестированием желательно временно прекратить прием всех препаратов (по согласованию с лечащим врачом);
- непосредственно перед сдачей крови желательно провести в спокойствии 10-15 минут.
Слюна
Материал собирается стерильный контейнер, который можно взять в пункте отбора пробы.
За полчаса до тестирования запрещается:
- есть;
- курить;
- чистить зубы;
- пить (исключение – простая вода).
В течение суток перед исследованием не употреблять спиртные напитки.
Материал необходимо доставить в пункт сбора в течение 5 часов. Если такой возможности нет, то слюну нужно заморозить в морозильной камере и доставить в замороженном состоянии.
Сперма
Образец материала собирается в стерильный пластиковый контейнер посредством мастурбации.
Моча
Перед сбором биоматериала необходимо:
- прекратить прием мочегонных средств;
- воздержаться от употребления фруктов и овощей, способных изменить цвет мочи;
- женщинам – не желательно отбирать пробу во время менструации.
Перед сбором мочи необходимо тщательно обмыть наружные половые органы.
Моча собирается сразу после утреннего пробуждения. Для этого используется пластиковый контейнер, который заполняется на треть сразу же, первой порцией. Остальная моча спускается в унитаз.
Материал необходимо доставить в пункт сбора в течение 5 часов. Если такой возможности нет, то мочу нужно заморозить в морозильной камере и доставить в замороженном состоянии.
Соскобы из мочеиспускательного и цервикального каналов
В цервикальном канале (канале шейки матки) материал отбирается в конце менструального цикла или в его начале, через 1-2 дня после окончания менструации.
Перед взятием соскоба запрещается:
- спринцевание;
- применение вагинальных мазей, свечей.
За 24-48 часов до отбора пробы необходимо воздержаться от половых актов.
Исследование не проводится после следующих процедур:
- мануальное исследование;
- инструментальное исследование;
- ультразвуковое исследование;
- кольпоскопия;
- биопсия и пр.
Соскоб из мочеиспускательного канала берется перед опорожнением мочевого пузыря или через 1,5-2 часа после естественного выделения мочи.
Интерпретация исследования
Ответ выдается на бланке лаборатории медицинской компании "Наука". К нему прилагается выписка со списком исследуемых микроорганизмов, референсными значениями, величинами допустимых отклонений от нормы и сравнительной диаграммой (отклонение/норма). В выписке красным шрифтом отмечаются представители резидентной (постоянной) микрофлоры, синим шрифтом – транзиторной (временной). Также пациент получает дополнительную информацию, содержащую заключение и рекомендации по результатам проведенного исследования.
Результат теста выдается на бланке лаборатории медицинской компании «Наука». Пример анализа, в котором исследуемым биотопом является тонкая кишка, представлен ниже:
Ф.И.О.: Иванов Сидор Петрович Пол: м Дата рождения: хх.хх.хххх
Дата исследования: хх.хх.хххх
Исследование
|
Результат
|
Нормы интерпретации
|
Примечание
|
Бактериология
|
[427] Хромато масс-спектрометрия микробных маркеров
|
См. выписку
|
|
Дата выдачи (дата исследования): хх.хх.хххх
|
Выписка:
№
|
анаэробы
|
Микроорганизм
|
Проба
|
Норма – средний арифметический показатель
|
Допустимый интервал отклонений от нормы*
|
Встречаемость в данном биотопе
|
Резидентные м.о. Определяются > 50% случаев
|
кл/г х 10^5
|
кл/г х 10^5
|
кл/г х 10^5
|
%
|
1
|
Ан
|
Actinomyces spp
|
3
|
14
|
16
|
71
|
2
|
Ан
|
Actinomyces viscosus
|
969
|
670
|
259
|
97
|
3
|
|
Alcaligenes spp
|
117
|
60
|
40
|
86
|
4
|
Ан
|
Bifidobacterium spp.
|
3734
|
3203
|
2052
|
91
|
5
|
Ан
|
Clostridium coccoides
|
118
|
76
|
100
|
93
|
6
|
Ан
|
Clostridium perfringens
|
0
|
110
|
147
|
99
|
7
|
Ан
|
Clostridium propionicum
|
77
|
119
|
81
|
92
|
8
|
Ан
|
Clostridium ramosum
|
1975
|
1721
|
1033
|
97
|
9
|
Ан
|
Clostridium ramosum
|
237
|
438
|
290
|
100
|
10
|
|
Corineform CDC-group XX
|
71
|
79
|
56
|
99
|
11
|
Ан
|
Eggerthella lentа
|
483
|
273
|
221
|
100
|
12
|
Ан
|
Eubacterium spp.
|
6246
|
5743
|
3438
|
100
|
13
|
Ан
|
Fusobacterium/Haemophylus
|
0
|
5
|
4
|
81
|
14
|
Ан
|
Lactobacillus spp.
|
1021
|
1043
|
1030
|
97
|
15
|
|
Lactococcus spp.
|
0
|
563
|
498
|
99
|
16
|
|
Nocardia asteroides
|
335
|
1063
|
872
|
100
|
17
|
Ан
|
Prevotella spp.
|
0
|
28
|
16
|
100
|
18
|
Ан
|
Propionibacterium acnes
|
13
|
22
|
34
|
55
|
19
|
Ан
|
Propionibacterium freudenreichii
|
2591
|
1848
|
1147
|
100
|
20
|
Ан
|
Propionibacterium jensenii
|
0
|
50
|
69
|
54
|
21
|
|
Pseudonocardia spp.
|
0
|
17
|
24
|
66
|
22
|
|
Rhodococcus spp.
|
65
|
72
|
62
|
100
|
23
|
Ан
|
Ruminococcus spp.
|
765
|
460
|
264
|
100
|
24
|
Ан
|
Staphylococcus
|
374
|
464
|
175
|
100
|
25
|
Ан
|
Staphylococcus epidermidis
|
10
|
72
|
44
|
91
|
26
|
Ан
|
Streptococcus mutans (анаэробн)
|
270
|
182
|
103
|
100
|
27
|
Ан
|
Streptococcus spp.
|
0
|
138
|
152
|
81
|
28
|
|
Streptomyces spp.
|
133
|
90
|
101
|
67
|
Транзиторные м.о. Определяются < 50% случаев
|
кл/г х 10^5
|
кл/г х 10^5
|
кл/г х 10^5
|
%
|
29
|
|
Bacillus cereus
|
0
|
2
|
2
|
15
|
30
|
Ан
|
Bacteroides fragilis
|
0
|
1
|
1
|
7
|
31
|
Ан
|
Bacteroides hypermegas
|
0
|
0
|
0
|
4
|
32
|
Ан
|
Campylobacter mucosalis
|
0
|
0
|
0
|
1
|
33
|
Ан
|
Clostridium difficile
|
0
|
0
|
0
|
4
|
34
|
Ан
|
Clostridium hystolyticum
|
0
|
7
|
5
|
17
|
35
|
|
Enterococcus spp.
|
0
|
4
|
3
|
17
|
36
|
|
Flavobacterium spp.
|
0
|
0
|
0
|
2
|
37
|
Ан
|
Helicobacter pylor
|
0
|
3
|
1
|
19
|
38
|
|
Kingella spp.
|
0
|
0
|
0
|
1
|
39
|
|
Acinetobacter spp.
|
0
|
0
|
0
|
1
|
40
|
Ан
|
Peptostreptococcus anaerobius 17642
|
0
|
0
|
0
|
4
|
41
|
Ан
|
Peptostreptococcus anaerobius 18623
|
0
|
14
|
11
|
11
|
42
|
Ан
|
Porphyromonas spp.
|
0
|
0
|
0
|
1
|
43
|
Ан
|
Prevotella ruminicola
|
0
|
1
|
4
|
9
|
44
|
|
Pseudomonas aeruginosa
|
0
|
0
|
0
|
1
|
45
|
Ан
|
сем. Enterobacteriaceae (E.coli и пр)
|
0
|
0
|
0
|
1
|
Микроскопические грибы
|
кл/г х 10^5
|
кл/г х 10^5
|
кл/г х 10^5
|
%
|
46
|
|
Candida spp.
|
427
|
493
|
324
|
100
|
47
|
|
Aspergillus spp.
|
94
|
188
|
125
|
100
|
48
|
|
Micromycetes spp (кампестерол)
|
1124
|
795
|
554
|
99
|
49
|
|
Micromycetes spp (ситостерол)
|
1855
|
857
|
517
|
99
|
Вирусы**
|
|
|
|
|
50
|
|
Herpes simplex
|
1102
|
800
|
498
|
100
|
51
|
|
Вирус Эпштейна-Барр
|
0
|
260
|
391
|
53
|
52
|
|
Цитомегаловирус
|
0
|
384
|
695
|
41
|
В норме не встречаются
|
|
|
|
|
53
|
|
Bacillus megaterium
|
0
|
0
|
0
|
0
|
54
|
|
Chlamidia trachomatis
|
0
|
0
|
0
|
0
|
55
|
|
Mycobacterium spp.
|
0
|
0
|
0
|
0
|
56
|
Ан
|
Propionibacterium spp.
|
0
|
0
|
0
|
0
|
57
|
|
Stenotrophomonas maltophilia
|
0
|
0
|
0
|
0
|
58
|
|
Streptomyces farmamarensis
|
0
|
0
|
0
|
0
|
Соотношения результатов по сгруппированным м.о.
Микроорганизм
|
Нагрузка
|
Норма
|
% от ОБН
|
Резидентные
|
19600
|
19623
|
100.0
|
Транзиторные
|
0
|
33
|
0.0
|
В норме нет
|
0
|
0
|
0.0
|
Из них анаэробы
|
18878
|
17705
|
96.3
|
Общая бактериальная нагрузка (ОБН)
|
19600
|
19656
|
|
Микрогрибы
|
3501
|
2332
|
|
Вирусы
|
1102
|
1444
|
|
Плазмалоген (по 16а)
|
53.83
|
50
|
мкг/мл
|
Эндотоксин (сумма)
|
0.36
|
0,5
|
наномоль/мл
|
* Доверительный интервал – это пределы допустимых отклонений среднего арифметического показателя, т.е. интервал нормы. Избыток или недостаток микроорганизмов находится за пределами доверительного интервала.
** Отчет по вирусной нагрузке для удобства оценки ведется в условных компьютерных единицах и обозначает не количество вирусных тел, а маркерную (химическую) нагрузку.