Описание исследования
Панель «Детские наследственные опухоли» позволяет установить наличие врожденных
(герминальных) патогенных мутаций в 19 генах, достоверно ассоциированных с повышенным
риском развития различных новообразований у детей. Острый лимфобластный лейкоз является
наиболее распространенным гемобластозом детского возраста и составляет более трети всех
онкологических диагнозов у детей и подростков. Считается, что большинство злокачественных
новообразований, возникающих у детей, носят спорадический характер, и генетическая
предрасположенность прослеживается крайне редко. Однако небольшая доля лейкозов и
солидных опухолей у детей обусловлена наследственными опухолевыми синдромами.
Наследственные злокачественные новообразования, наиболее часто встречающиеся у детей,
включают опухоль Вильмса (мутации в гене WT1) и медуллобластому (мутации в гене SUFU).
Наиболее известным среди врачей онкологов является синдром Ли-Фраумени (мутации в гене
TP53). Синдром характеризуется появлением сарком мягких тканей, остеосарком,
адренокртикального рака, рака молочной железы, опухолей головного мозга и лейкозов. Другие
наследственные опухолевые синдромы у детей: наследственная феохромоцитома-параганглиома
(гены субъединиц SDH), синдром предрасположенности к плевропульмональной бластоме
(DICER1), синдром предрасположенности к рабдоидным опухолям (мутации в гене SMARCB1) и
синдром множественной эндокринной неоплазии (мутации генов MEN1 и RET). В частности, когда
у детей обнаруживают рак, обычно встречающихся у взрослых, например меланома или рак
толстой кишки, также следует подозревать лежащую в основе генетическую причину.
Метод исследования и его клиническая эффективность:
В основе диагностики с использованием панели «Детские наследственные опухоли» лежит метод
высокопроизводительного секвенирования ДНК (Next Generation Sequencing, NGS) со средним
покрытием в кодирующих областях генов и сайтах сплайсинга не менее 80х.
Ограничения метода:
Метод не выявляет генетические варианты в повторяющихся вариантах генома (гены, имеющие
псевдогены, паралоги, сегментарные повторы). Точность метода, также снижена в сложных
участках генома (GC богатые и poly-n участки).
Заключение по результатам исследования:
В заключение включаются патогенные, вероятно-патогенные генетические варианты и варианты с
неизвестным клиническим значением, их описание и интерпретация. По запросу пациента
выдается файл со списком всех вариантов, обнаруженных в исследуемых генах.
Список генов, входящих в панель:
ALK, APC, AXIN2, BAP1, BLM, BMPR1A, BRAF, BUB1B, CBL, CDC73, CDKN1C, CEBPA, DICER1, DIS3L2,
EPCAM, EZH2, FH, GATA2, GPC3, HRAS, KRAS, LZTR1, MAP2K1, MAP2K2, MAX, MEN1, MLH1, MSH2,
MSH6, NBN, NF1, NF2, NRAS, NSD1, NSUN2 , PAX5, PHOX2B, PMS2, PRF1, PRKAR1A, PTCH1, PTEN,
PTPN11, RAF1, RASA2, RECQL4, REST, RET, RIT1, RRAS, RUNX1, SDHA, SDHAF2, SDHB, SDHC, SDHD,
SHOC2, SMAD4, SMARCA, SMARCB1, SOS1, SOS2, STK11, SUFU, TMEM127, TP53 , TSC1, TSC2, VHL,
WRN, WT1.
