Описание исследования
Тест позволяет установить наличие мутаций в 2 генах, ассоциированных с гастроинтестинальными
стромальными опухолями (ГИСО): KIT (c-KIT), PDGFRA.
Ген KIT (c-KIT) является протоонкогеном и кодирует рецептор фактора роста тучных и стволовых
клеток SCFR, также известный как CD117 и представляющий собой рецепторную тирозинкиназу
KIT.
Связывание рецептора CD117 с лигандом приводит к активации сигнальных путей, приводящих к
выживанию, пролиферации и дифференцировке клеток. В опухоли рецептор KIT непосредственно
принимает участие в опухолевой прогрессии, стимулируя пролиферацию клеток и снижая
чувствительность к апоптотическим сигналам. Мутации гена KIT приводят к нарушению данных
сигнальных путей и встречаются у 85% пациентов c гастроинтестинальными стромальными
опухолями. Подавляющее число мутаций в гене KIT расположены в 9, 11, 13 и 17 экзонах.
Наличие мутаций в гене KIT может иметь предиктивное значение при назначении таргетной
терапии. Так, например, мутация в 816 домене (D816V) делает опухоль резистентной к ингибитору
тирозинкиназы KIT – иматинибу.
Ген PDGFRA кодирует рецептор факторов роста тромбоцитов (platelet-derived growth factor, PDGF),
принимающий участие в таких клеточных процессах как клеточный рост и дифференцировка.
Мутации в гене PDGFRA встречаются в 5% случаев ГИСО. Наиболее часто встречаются мутации в 12
и 18 экзонах. Мутации, расположенные в 12 и 18 экзонах (за исключением мутации D842V),
ассоциированы с чувствительностью опухоли к иматинибу.
Метод исследования: секвенирование ДНК нового поколения (Next Generation Sequencing, NGS).