Описание исследования
Панель "Наследственные заболевания сердца" включает анализ 219 генов связанных с
кардиологическими синдромами. На сегодняшний день известно, что многие кардиологические
заболевания являются наследственными, то есть генетически детерминированными. При этом
наследственное заболевание не всегда является врожденным, и может проявиться впервые во
взрослом, а иногда даже в пожилом возрасте. У пациентов уже страдающих кардиологической
патологией, генетическое тестирование может помочь при уточнении диагноза. Например, для
дифференциальной диагностики между первичной легочной гипертензией и последствиями
недиагностированной тромбоэмболии легочной артерии. Постановка точного диагноза
способствует, подбору правильной, эффективной терапии, а также уточнению прогноза для
дальнейшего развития заболевания, трудоспособности пациента и качества жизни. К сожалению,
иногда первое же проявление заболевания может оказаться фатальным. Например, известно, что
существуют гены, повышающие риск синдрома внезапной смерти. Информация о наличии
неблагоприятных вариантов таких генов в генотипе помогает разработать индивидуальную
профилактику, избегать в течение жизни факторов риска, которые могут спровоцировать начало
заболевания. Например, в некоторых случаях женщинам противопоказана беременность, либо
беременность может быть возможна, но будет рекомендовано только оперативное
родоразрешение.
В панель включены такие заболевания как:
Врожденные синдромы удлиненного и укороченного интервала QT;
Катехоламинергическая желудочковая тахикардия,
Синдром Бругада;
«Идиопатическая» фибрилляция желудочков.
Врожденный синдром слабости синусового узла
Семейная фибрилляция предсердий
Моногенные синдромы, сопровождающиеся пороками сердца или нарушением функции сердца
Изолированные врожденные пороки сердца
Кардиомиопатии
Семейная гиперхолестеринемия и нарушения липидного спектра
Первичная легочная гипертензия
Дисплазия соединительной ткани (приводящая к сердечно-сосудистой патологии)
Виды генетических изменений, определяемых панелью "Наследственные заболевания сердца":
Однонуклеотидные и мультинуклеотидные варианты (SNV и MNV) в экзонах всех клинически
значимых генов;
Малые вставки-делеции (in/del) до 50 пар нуклеотидов в экзонах всех клинически значимых
генов;
Вариации числа копий генов (CNV), такие как делеции/микроделеции и
дупликации/микродупликации среднего и крупного размера (с ограничениями).
Метод исследования и его клиническая эффективность:
Секвенирование нового поколения (NGS) со средним числом прочтений каждого участка генома
не менее 70x (это означает, что каждый участок генома прочитывается в среднем не менее 70 раз
для снижения влияния технических ошибок сиквенса на результаты исследования). При
секвенировании генов, включенных в панель "Наследственные заболевания сердца", вероятность
обнаружения причины заболевания составляет 20-45% .
Ограничения метода:
Метод не выявляет генетические варианты в повторяющихся вариантах генома (гены, имеющие
псевдогены, паралоги, сегментарные повторы). Точность метода, также снижена в сложных
участках генома (GC богатые и poly-n участки).
Заключение по результатам исследования:
В результате исследования может быть получена информация о тысячах генетических вариантов,
которые, как правило, являются непатогенными, даже если и находятся в клинически значимых
генах. Для оценки патогенности каждого обнаруженного варианта используются специальные
алгоритмы, которые позволяют выделить только варианты, которые с наибольшей вероятностью
могут быть патогенными. Таких вариантов может быть от нескольких до нескольких десятков.
Если при заказе исследования пациент представил медицинскую документацию, то среди
клинически значимых вариантов вариантов выбираются те, которые имеют отношение к фенотипу
пациента. В заключение включаются только варианты, являющиеся патогенными и вероятно
патогенными в соответствии с критериями ACMG или классифицированы таковыми в базе данных
ClinVar и имеющие связь с фенотипом пациента. К заключению прилагается файл со всеми
обнаруженными вариантами. Однако, следует знать, что интерпретация данных секвенирования
является непростой задачей, требующих специальных знаний. Только врач-генетик, прошедший
специальную подготовку может дать правильную консультацию по результатам исследования.
Следующее обследование:
При выявлении клинически значимых вариантов может потребоваться обследование родителей
пробанда или других родственников. Если тест не выявил причины заболевания но подозрение на
его генетическую причину осталось, то пациенту может быть рекомендовано исследование
следующего уровня - клиническое секвенирование экзома, полное секвенирвоание экзома,
клиническое секвенирование генома или полное секвенирование генома.
Список основных генов, включенных в панель "Наследственные заболевания сердца":
ABCC9, ABCG5, ABCG8, ACTA1, ACTA2, ACTC1, ACTN2, ACVR1, ACVR2B, AKAP9, AKT3, ALMS1, ANK2,
ANO5, APOA5, APOB, APOC2, APOE, ATP2A2, BAG3, BIN1, BMPR2, BRAF, CACNA1C, CACNA1D, CACNB2,
CALM1, CALR3, CASQ2, CAV3, CBL, CBS, CETP, CFC1, CFL2, CHD7, CITED2, CNTN1, COL3A1, COL5A1,
COL5A2, COX15, CRELD1, CRYAB, CSRP3, CTNNA3, DES, DMD, DNAJC19, DNM2, DOLK, DPP6, DSC2,
DSG2, DSP, DTNA, DYSF, EFEMP2, ELN, EMD, EYA4, FBN1, FBN2, FHL1, FKRP, FKTN, FLNA, FLNC, FOXC1,
FXN, GAA, GATA4, GATA6, GATAD1, GCKR, GDF1, GJA1, GJA5, GLA, GNAI2, GNE, GPD1L, GPIHBP1,
HADHA, HCN4, HFE, HRAS, HSPB8, ISCU, JAG1, JPH2, JUP, KBTBD13, KCNA5, KCND3, KCNE1, KCNE2,
KCNE3, KCNH2, KCNJ2, KCNJ5, KCNQ1, KRAS, LAMA2, LAMA4, LAMP2, LDB3, LDLR, LDLRAP1, LEFTY2,
LMF1, LMNA, LPL, LTBP2, MAMLD1, MAP2K1, MAP2K2, MATR3, MED13L, MEGF10, MSTN, MTM1,
MYBPC1, MYBPC3, MYF6, MYH11, MYH2, MYH6, MYH7, MYL2, MYL3, MYLK, MYLK2, MYO6, MYOT,
MYOZ2, MYPN, NEB, NEXN, NF1, NKX2-5, NKX2-6, NODAL, NOTCH1, NOTCH2, NPPA, NRAS, PABPN1,
PCSK9, PIK3CA, PIK3R2, PITX2, PKP2, PLEC, PLN, PRKAG2, PRKAR1A, PSEN1, PSEN2, PTPN11, RAF1,
RASA1, RBM10, RBM20, RYR1, RYR2, SALL4, SCN10A, SCN1B, SCN2B, SCN3B, SCN4B, SCN5A, SCO2,
SDHA, SEMA3E, SEPN1, SGCB, SGCD, SGCG, SHOC2, SLC25A4, SLC2A10, SMAD3, SMAD4, SMAD6, SNTA1,
SOS1, SPRED1, TAB2, TAZ, TBX1, TBX20, TBX3, TBX5, TCAP, TFAP2B, TGFB2, TGFB3, TGFBR1, TGFBR2,
TLL1, TMEM43, TMPO, TNNC1, TNNI3, TNNT1, TNNT2, TPM1, TPM2, TPM3, TRDN, TRPM4, TTN, TTR,
VCL, VCP, ZFPM2, ZIC3
